تعتبر المكتبة المركزية من اهم واعظم الانجازات لعمادة المكتبات ولجامعة الجزيرة، فقد تم تصميمها على احدث النظم الهندسية لتكون مكتبة مركزية على احدث طراز معمارى وتم الانتهاء منها وافتتاحها على يد السيد مدير الجامعة فى شهر سبتمبر عام 2016 وهى تتكون من اربعة طوابق، فالطابق تحت الارض تم تخصيصه للارشفة الالكترونية ولقسم التجليد والتصوير، اما الطابق الارضى فهو مخصص لمكاتب الادارة العميد ونائبه والسكرتارية وقاعة الاجتماعات، والطابق الاول تم تخصيصه لقاعة المطالعة الرئيسية بالاضافة الى قاعة المكتبة الالكترونية وقاعة للاساتذة وطلاب الدراسات العاليا يضم الرسائل الجامعية والدوريات العلمية، اما الطابق الثانى والاخير فهو يضم ثلاثة قاعات مطالعة عامة للطلاب بالاضافة الى قاعتين للسمنارات واستراحة ومصلى.
والمبنى حديث ومكيف تكييفا مركزيا وبه مصعد كهربائى ونظام الى للاطفاء بالاضافة الى عدد من اجهزة الحاسوب والمخدمات والطرفيات والطابعات والماسحات الضوئية ، ويحتوى المبنى على اثاثات حديثة كالطاولات والمقاعد والرفوف الحديدية، ويتسع المبنى الى 800 اجلاس للقراء وهو بذلك يشكل اضافة حقيقية ونقلة نوعية للخدمات المتميزة التى تقدمها العمادة لاسرة الجامعة.
ويقع مبنى المكتبة المركزية الجديدة مباشرة جنوب مبانى ادارة الجامعة الحالية بالنشيشيبة.
تتكون مكتبة الجامعة الآن من مكتبة مركزية من جزءين المكتبة المركزية الغربية وهى تقع شرق عمادة الطلاب بالقرب من مسجد الجامعة وتضم كتباً ومراجعاً للزراعة والهندسة و التكنولوجيا والنسيج
المكتبة الشرقية وهى تقع فى الطابق الأول من مبنى كلية النسيج وهى تضم كتب الاقتصاد ولتنمية الريفية بالإضافة الى عدد 25 مكتبة فرعية بمجمعات مختلفة لعل أكبرها مكتبة الطب بمجمع الرازي ومكتبة حنتوب للتربية بحنتوب وغيرها الكثير.