تأسست المكتبة في عام 1980مفي مساحة قدرها 80 متراً مربعاً وتضم مجموعة من التقارير السنوية لمشروع النيل الازرق الصحي منذ عام 1880موحتى عام 1995م تختص مجموعاتها بعلوم الملاريا وفي عام 2007م تمت اضافة مجموعة من المراجع والكتب تختص بعلوم الحشرات الطبية ومكافحة الناقل للملاريا يبلغ عددها 128 عنواناً باللغة الانجليزية و12 عنواناً باللغة العربية و80 رسالة جامعية و51 بحثاًوعدد529 من منشورات منظمة الصحة العالمية(WHO)وتقدم خدماتها لطلاب الدبلوم العالي والماجستير